52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2338 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  279  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  49.12 
 
 
115 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  48.57 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  44.23 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  43.81 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  43.81 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  41.82 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  41.9 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  41.28 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  41.28 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  39.25 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  41.9 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  40 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  45.19 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  37.86 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  35.58 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  38.38 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  34.55 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  34.31 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  34.31 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  37.37 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  37.5 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  31.73 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  36.14 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  33.98 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  34.95 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37350  hypothetical protein  35.64 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000234066  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  42.03 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  32.5 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  31.73 
 
 
112 aa  48.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  32.69 
 
 
124 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  31.03 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  32.5 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  45.16 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  36.49 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  34.26 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  31.62 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  33.9 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3204  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  30.39 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  30.39 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  33.9 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>