63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2272 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  207  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  49.02 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  48.54 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  47.06 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  45.1 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  47.96 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  43.69 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  45.1 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  43.14 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  48.94 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  42.16 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  45.45 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  43.68 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  43.27 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  36.46 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  42 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  44.9 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  42 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  43.18 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  43.18 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  41.51 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  38.68 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  39.8 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  46.15 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  40.21 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  44.62 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  38.54 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  41.24 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  35.29 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  35.29 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  41.18 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  39.18 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  39.62 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  35.19 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  36.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  41.3 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  34.26 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  35.85 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  45.88 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  47.06 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  39.18 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  44.71 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3037  putative cytoplasmic protein  44.32 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  42.31 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  33.94 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  45.16 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4281  hypothetical protein  50.59 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  37.74 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  41.43 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37350  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000234066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>