60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0085 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  68.84 
 
 
144 aa  188  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  59.42 
 
 
136 aa  146  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  55.8 
 
 
135 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  55.56 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  56.3 
 
 
141 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  54.2 
 
 
134 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  51.08 
 
 
156 aa  134  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  52.67 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  54.07 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  54.96 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  48.89 
 
 
139 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  54.07 
 
 
133 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  57.97 
 
 
135 aa  123  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  48.51 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  49.25 
 
 
133 aa  116  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  47.76 
 
 
136 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  48.84 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  48.84 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  54.81 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  54.81 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  54.81 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  42.37 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  41.18 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  38.79 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  42.61 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  38.53 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  40.91 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  37.61 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  37.61 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  39.64 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  39.82 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  42.35 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  38.74 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  38.89 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  38.94 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  38.94 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  34.58 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  40.35 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  38.46 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  35.4 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  38.26 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  38.26 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  41.35 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  32.74 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  38.54 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  30.33 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  38.74 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  37.84 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  29.89 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4281  hypothetical protein  28.33 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  34.23 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  28.36 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  36.47 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  28.41 
 
 
117 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>