68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6438 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  99.07 
 
 
107 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  59.43 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  59.43 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  57.28 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  56.07 
 
 
108 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  56.19 
 
 
109 aa  105  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  54.29 
 
 
108 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  55.34 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  53.85 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  53.92 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6407  hypothetical protein  79.55 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00903722  normal  0.080212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5659  hypothetical protein  77.78 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.879701 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  54.21 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  52.88 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  46.73 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5433  hypothetical protein  74.6 
 
 
116 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31412  normal  0.0551629 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  43.93 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  43.93 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  50 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  47.12 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  48.15 
 
 
122 aa  87  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  44.12 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  52.87 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  52.87 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  57.61 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  42.86 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  45.71 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  45.28 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  45.28 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  45.28 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  41.51 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  44.76 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  46.25 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  40.95 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  48.24 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  41.9 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  38.68 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  38.46 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  35.58 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  42.72 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  41.24 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  40.2 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  41.9 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  39.81 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  34.29 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  33.33 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  36.45 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  42.73 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  42.73 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  42.73 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  36.11 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  33.33 
 
 
133 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  40.62 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  33.04 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  37.27 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  34.55 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  40.2 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  34 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  32.17 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  33.64 
 
 
108 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  31.76 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  31.76 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  35.85 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>