56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05446 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  69.92 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  69.92 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  44.74 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  36.79 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  40.21 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  37.14 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  38.46 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  38.46 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  32.14 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  35.64 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  38.46 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  36.27 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  37.21 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  37.21 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  35.64 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  39.22 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  35.45 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  39.58 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  35.45 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  33.65 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  33.65 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  34.19 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  31.43 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  33.05 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  34.45 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  30.95 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  39.56 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  34.45 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  34.92 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  33.05 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  33.93 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  39.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  36.67 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  38.6 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  31.62 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  31.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  30.36 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  33.04 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  30.58 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  39.13 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  35.58 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  35.53 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  29 
 
 		 138 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>