61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3873 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  100 
 
 		 141 aa  276  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  95.04 
 
 		 141 aa  263  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  56.3 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  50 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  55.3 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  50.76 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  49.63 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  48.06 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  48.84 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  48.06 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  47.37 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  49.22 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  49.22 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  42.42 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  50.39 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  45.08 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  45.08 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  45.08 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  43.75 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  48.41 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  48.41 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  48.41 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  39.64 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  42.16 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  36.54 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  36 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  42.53 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  37.86 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  35.2 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  40.78 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  40.78 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  40.78 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  37.74 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  36.45 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  37.96 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  34.75 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  39.42 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  39.42 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  39.22 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  39.42 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  40.43 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  36.56 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  35.48 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  34.45 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  40.24 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  36.14 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  39.6 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  38.1 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  38.1 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  38.55 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  40.79 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  36.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  44.64 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  41.67 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  37.76 
 
 		 139 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  30.34 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>