44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2991 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  229  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  39.64 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  38.74 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  44.83 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  37.27 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  38.24 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  35.19 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  35.19 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  35.19 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  37.37 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  37.04 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  33.94 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  32.38 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  34.55 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  35.19 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  34.55 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  31.53 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  30.84 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  34.26 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  32.17 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  32.17 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  33.94 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  30.91 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  31.82 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  29.09 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  40.4 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  31.48 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  30.56 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  30.56 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  32.67 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  29.81 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  29.81 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  27.78 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  28.32 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  28.7 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  29.73 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  32 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>