44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2537 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  100 
 
 
110 aa  221  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  94.55 
 
 
110 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  84.55 
 
 
110 aa  190  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  80.91 
 
 
110 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  68.18 
 
 
110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  67.27 
 
 
110 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  66.36 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  65.45 
 
 
110 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  61.47 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  57.41 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  57.55 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  60.91 
 
 
110 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  48.18 
 
 
111 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  43.64 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  42.73 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  41.28 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  35.78 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  40 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  40 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  36.27 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  37.17 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  35.58 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  32.95 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  34.55 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  38.61 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  35.78 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  35.78 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  33.03 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  40.96 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  37.74 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  35.58 
 
 
109 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  34.91 
 
 
108 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  34.95 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  35.92 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  35.92 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  37.08 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  37.08 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  34.62 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  34.86 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  31.19 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  33.98 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  32.69 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  30.58 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>