47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0742 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  72.73 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  71.82 
 
 		 110 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  70.91 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  65.45 
 
 		 110 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  62.73 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  63.64 
 
 		 110 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  61.82 
 
 		 110 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  56.6 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  54.72 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  54.72 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  56.36 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  59.09 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  43.36 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  42.48 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  43.81 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  38.83 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  40.19 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  40 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  40.57 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  37.61 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  40.23 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  37.39 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  35.29 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  48.57 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  48.57 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  35.92 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  34.58 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  36.89 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  35.92 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  36.61 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  37.61 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  33.06 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  30 
 
 		 134 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  38.24 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3858  hypothetical protein  31.43 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  34.33 
 
 		 112 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>