40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2616 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  217  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  40.87 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  52.34 
 
 
120 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  39.29 
 
 
111 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  39.09 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  37.17 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  35.4 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  37.04 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  37.72 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  43.82 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  60.75 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  36.94 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  35.78 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  36.11 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  34.86 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  32.99 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  33.04 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  30.84 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  34.55 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  33.94 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  31.07 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  35 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  37.84 
 
 
118 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  33.61 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  33.01 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  33.94 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  31.53 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  28.97 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  29.52 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  30.1 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  31.43 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  31.48 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  30.56 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  27.12 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37350  hypothetical protein  24.76 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000234066  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  28.85 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  28.97 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  28.97 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>