45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1100 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  94.55 
 
 		 110 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  86.36 
 
 		 110 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  80 
 
 		 110 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  69.09 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  68.18 
 
 		 110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  67.27 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  62.73 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  60.55 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  59.43 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  56.48 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  61.82 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  48.18 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  41.82 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  40.91 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  41.28 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  34.95 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  40 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  35.78 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  37.17 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  38.32 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  36.27 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  32.95 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  33.94 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  35.19 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  35.58 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  36.27 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  37.74 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  34.86 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  34.86 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  35.19 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  43.59 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  34.86 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  34.95 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  35.24 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  34.95 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  33.04 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  33.65 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  33.98 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  32.08 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  31.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  28.95 
 
 		 133 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>