38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2812 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  68.18 
 
 		 110 aa  157  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  61.82 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  63.64 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  60.91 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  57.27 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  59.09 
 
 		 110 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  57.27 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  56.36 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  57.94 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  54.55 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  55.14 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  53.27 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  46.73 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  45.87 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  45.19 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  37.86 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  33.94 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  34.55 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  32.73 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  30.23 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  37.25 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  37.61 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  36.54 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  37.74 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  38.55 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  36.11 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  34.26 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  37.86 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  35.19 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  37.14 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  35.92 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  35.24 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  33.64 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  33.98 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  32.46 
 
 		 136 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>