45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0107 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  86.36 
 
 		 110 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  84.55 
 
 		 110 aa  190  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  82.73 
 
 		 110 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  66.36 
 
 		 110 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  66.36 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  63.64 
 
 		 110 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  63.21 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  62.39 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  60.19 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  68.18 
 
 		 110 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  54.13 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  42.2 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  40.91 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  40 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  36.89 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  35.58 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  34.86 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  39.25 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  36.54 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  38.74 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  38.1 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  34.55 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  38.68 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  30.23 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  34.31 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  33.98 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  37.04 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  41.03 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  33.98 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  37.08 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  37.08 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  32.08 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  35.92 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  33.94 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  32.11 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  31.78 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  31.31 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  34.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  30.97 
 
 		 136 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>