52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3204 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  95.95 
 
 		 183 aa  322  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  78.21 
 
 		 181 aa  287  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  76.37 
 
 		 183 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  69.61 
 
 		 186 aa  267  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  69.06 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  68.89 
 
 		 186 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  68.85 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  68.54 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  66.67 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  68.54 
 
 		 183 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  66.48 
 
 		 184 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  65.38 
 
 		 184 aa  247  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  65.38 
 
 		 184 aa  247  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  60.54 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  59.34 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  65.54 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  58.72 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  51.41 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  50.85 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  45.86 
 
 		 179 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  49.17 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  44.07 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  46.29 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  46.29 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  46.15 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  41.62 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  40.49 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  73.26 
 
 		 82 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  51.33 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  42.41 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  42.77 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  44.1 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  36.88 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  40.25 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  36.91 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  36.91 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  38.06 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  37.04 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  52.63 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  52.63 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  52.38 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  58.33 
 
 		 192 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.970173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>