48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1303 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  319  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  62.11 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  56.6 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  39.75 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  43.87 
 
 		 179 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  42.94 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  41.72 
 
 		 199 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  41.72 
 
 		 199 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  40.56 
 
 		 200 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  37.66 
 
 		 193 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  44.44 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  46.43 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  42.47 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  32.87 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  37.59 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  37.35 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  37.27 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  33.56 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  36.02 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  36.65 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  36.02 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  36.21 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  36.65 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  36.65 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  37.04 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  36.97 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  35.86 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  35.37 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  39.16 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  32.47 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  38.71 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  37.76 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  34.18 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  34.67 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.970173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>