45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2276 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  48.07 
 
 		 192 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  47.16 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  47.16 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  47.16 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  47.16 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  47.16 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  46.07 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  47.16 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  47.24 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  47.56 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  46.02 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  47.24 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  43.93 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  47.85 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  46.95 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  46.63 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  48.78 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  46.63 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  43.18 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  38.59 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  44.63 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  43.35 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  41.76 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  43.83 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  44.74 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  38.29 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  44.59 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  36.69 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  40.94 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  43.33 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  47.37 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  41.72 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  42.58 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  39.51 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  37.69 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>