49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5183 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  96.13 
 
 		 183 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  94.54 
 
 		 183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  93.92 
 
 		 184 aa  351  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  93.37 
 
 		 184 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  93.37 
 
 		 184 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  89.5 
 
 		 183 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  74.16 
 
 		 186 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  73.6 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  73.6 
 
 		 183 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  73.6 
 
 		 183 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  73.6 
 
 		 183 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  73.6 
 
 		 183 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  73.6 
 
 		 183 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  73.48 
 
 		 181 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  71.35 
 
 		 186 aa  268  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  73.03 
 
 		 183 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  68.54 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  69.36 
 
 		 183 aa  234  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  59.12 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  56.59 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  61.99 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  62.21 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  46.11 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  46.11 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  48.04 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  46.37 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  46.33 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  47.56 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  47.56 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  41.57 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  39.76 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  46.88 
 
 		 200 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  44.19 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  38.15 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  38.1 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  39.63 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  39.38 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  59.77 
 
 		 82 aa  98.6  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  36.81 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  39.61 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  37.27 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  44.74 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  44.74 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>