48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1065 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  60.54 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  58.47 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  55.91 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  56.22 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  56.22 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  56.22 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  56.22 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  56.22 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  56.59 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  54.84 
 
 		 186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  56.22 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  56.59 
 
 		 183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  57.14 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  56.04 
 
 		 183 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  55.38 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  56.59 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  60.45 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  56.04 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  56.04 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  55.43 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  60.66 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  50.82 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  52.75 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  52.27 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  50.59 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  45.86 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  45.3 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  42.22 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  39.88 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  40.66 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  43.83 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  43.83 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  46.78 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  42.31 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  41.98 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  38.32 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  42.94 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  39.61 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  38.99 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  33.54 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  39.13 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  47.25 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  51.35 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  51.35 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>