50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3530 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 183 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  94.54 
 
 		 183 aa  348  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  78.89 
 
 		 181 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  77.47 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  77.47 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  77.47 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  77.47 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  77.47 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  69.83 
 
 		 186 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  69.83 
 
 		 186 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  69.27 
 
 		 186 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  69.66 
 
 		 183 aa  254  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  66.67 
 
 		 183 aa  252  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  67.98 
 
 		 183 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  67.42 
 
 		 184 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  67.98 
 
 		 183 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  66.29 
 
 		 184 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  66.29 
 
 		 184 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  61.54 
 
 		 182 aa  214  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  60.66 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  66.29 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  60.47 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  49.43 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  49.43 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  47.16 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  49.17 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  47.4 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  47.4 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  43.43 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  43.02 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  47.02 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  39.05 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  41.32 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  73.26 
 
 		 82 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  50.67 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  42.77 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  46.25 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  37.5 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  40.38 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  38.61 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  37.04 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  54.05 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  54.05 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  47.62 
 
 		 200 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>