50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1868 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  91.4 
 
 
186 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  76.88 
 
 
186 aa  294  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  74.72 
 
 
183 aa  277  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  73.03 
 
 
184 aa  273  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  73.6 
 
 
183 aa  273  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  73.6 
 
 
183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  72.47 
 
 
184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  72.47 
 
 
184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  72.47 
 
 
183 aa  270  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  69.06 
 
 
183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  68.51 
 
 
183 aa  261  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  67.96 
 
 
183 aa  260  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  67.96 
 
 
183 aa  260  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  67.96 
 
 
183 aa  260  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  67.96 
 
 
183 aa  260  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  67.96 
 
 
183 aa  260  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  69.83 
 
 
181 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  71.1 
 
 
183 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  57.22 
 
 
182 aa  206  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  54.84 
 
 
186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  58.89 
 
 
189 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  56.98 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  44.63 
 
 
193 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  46.89 
 
 
182 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  44.63 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  43.26 
 
 
179 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  41.44 
 
 
196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  44.38 
 
 
177 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  43.18 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  43.18 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  45.24 
 
 
192 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  44.05 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  36.93 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  39.87 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  40.61 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
182 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  62.35 
 
 
82 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  39.38 
 
 
200 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  40.24 
 
 
195 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  41.94 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  38.32 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  36.97 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  32.84 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  44.74 
 
 
221 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>