45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5187 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  73.22 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  52.17 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  53.7 
 
 		 182 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  42.16 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  41.18 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  40.59 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  40.59 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  40.59 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  40.94 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  38.24 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  40.35 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  38.51 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  40.35 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  37.78 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  41.36 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  37.21 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  38.51 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  38.04 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  32.02 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  38.27 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  38.27 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  37.25 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  37.95 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  37.95 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  37.06 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  35.76 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  39.62 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  38.93 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  35.12 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  38.56 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  39.52 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  36.23 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  35.53 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>