49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4655 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  94.54 
 
 
183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  94.48 
 
 
183 aa  350  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  93.37 
 
 
184 aa  346  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  92.82 
 
 
184 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  92.82 
 
 
184 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  90.06 
 
 
183 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  73.03 
 
 
186 aa  273  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  72.47 
 
 
186 aa  270  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  73.48 
 
 
181 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  73.6 
 
 
183 aa  267  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  73.6 
 
 
183 aa  267  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  73.6 
 
 
183 aa  267  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  73.6 
 
 
183 aa  267  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  73.6 
 
 
183 aa  267  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  73.03 
 
 
183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  69.66 
 
 
186 aa  263  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  68.54 
 
 
183 aa  250  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  68.79 
 
 
183 aa  230  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  56.91 
 
 
182 aa  216  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  56.59 
 
 
186 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  59.65 
 
 
189 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  60.47 
 
 
184 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  46.11 
 
 
193 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  47.49 
 
 
177 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  45.81 
 
 
193 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  43.02 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  45.76 
 
 
192 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  46.95 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  46.95 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
182 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  39.16 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  45.62 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  44.77 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  38.69 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 
182 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  36.42 
 
 
196 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  39.63 
 
 
200 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  59.77 
 
 
82 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  38.12 
 
 
195 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  36.81 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  39.61 
 
 
176 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  36.65 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  44.74 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  44.74 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>