50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0718 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  100 
 
 
192 aa  386  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  47.43 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  44.13 
 
 
196 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  50.59 
 
 
186 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  46.96 
 
 
184 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  48.07 
 
 
199 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  49.15 
 
 
179 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  48.07 
 
 
199 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  45.86 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  45.86 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  46.11 
 
 
183 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  46.07 
 
 
183 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  46.55 
 
 
183 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  46.55 
 
 
183 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  46.55 
 
 
183 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  46.55 
 
 
183 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  46.55 
 
 
183 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  46.55 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  49.15 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  45.51 
 
 
183 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  44.94 
 
 
181 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  45.51 
 
 
183 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  51.93 
 
 
193 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 
183 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  43.5 
 
 
186 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  48.47 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  45.2 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  35.91 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  45.24 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  45.83 
 
 
186 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  47.02 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  43.1 
 
 
182 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  50.62 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  44.58 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  47.31 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 
182 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  40.12 
 
 
200 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  40.51 
 
 
195 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  45.14 
 
 
181 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  43.84 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  44.44 
 
 
162 aa  91.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  43.05 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  38.81 
 
 
200 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3407  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3234  metal-dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.970173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3061  HD phosphohydrolase  36.76 
 
 
209 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>