28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3336 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  73.26 
 
 		 183 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  73.26 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  67.82 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  67.82 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  67.82 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  67.82 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  67.82 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  67.82 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  63.53 
 
 		 186 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  59.77 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  62.35 
 
 		 186 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  60.92 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  61.18 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  59.77 
 
 		 183 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  59.77 
 
 		 183 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  58.62 
 
 		 184 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  58.62 
 
 		 184 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  58.62 
 
 		 184 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  55.17 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  47.25 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  62.35 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  40 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  35 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  48.15 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  41.03 
 
 		 193 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>