24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1488 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1210  metal-dependent phosphohydrolase  69.89 
 
 		 195 aa  280  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1476  hypothetical protein  67.91 
 
 		 196 aa  268  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.288269  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3130  hypothetical protein  64.25 
 
 		 196 aa  261  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0593559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2610  metal dependent phosphohydrolase  69.66 
 
 		 190 aa  259  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.0160149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3234  metal-dependent phosphohydrolase  63.4 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3407  metal dependent phosphohydrolase  62.07 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3061  HD phosphohydrolase  61.58 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1669  hypothetical protein  63.04 
 
 		 204 aa  240  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  48.82 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.970173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  46.93 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  46.2 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  45.6 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2660  metal-dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2676  metal-dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560092  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2631  metal-dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  26.42 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  52.38 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  42.19 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  38.57 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  47.62 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>