28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0539 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1476  hypothetical protein  50.56 
 
 
196 aa  187  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.288269  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3130  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0593559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2610  metal dependent phosphohydrolase  50.28 
 
 
190 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.0160149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3407  metal dependent phosphohydrolase  49.72 
 
 
209 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3061  HD phosphohydrolase  49.72 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3234  metal-dependent phosphohydrolase  50.56 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1669  hypothetical protein  48.88 
 
 
204 aa  177  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  46.93 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  46.41 
 
 
184 aa  171  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1210  metal-dependent phosphohydrolase  48.02 
 
 
195 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
196 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.970173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  39.68 
 
 
221 aa  153  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  39.15 
 
 
189 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2660  metal-dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
188 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2676  metal-dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
188 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560092  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2631  metal-dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
188 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  29.27 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  29.88 
 
 
196 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0865  hypothetical protein  29.37 
 
 
273 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.90175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  28.4 
 
 
186 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  29.52 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  31.06 
 
 
193 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  26.63 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  40.91 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  58.33 
 
 
183 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  40.91 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>