22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2610 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2610  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.0160149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3407  metal dependent phosphohydrolase  70.21 
 
 
209 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3061  HD phosphohydrolase  70.21 
 
 
209 aa  276  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3234  metal-dependent phosphohydrolase  73.74 
 
 
203 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1476  hypothetical protein  69.57 
 
 
196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.288269  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3130  hypothetical protein  69.4 
 
 
196 aa  268  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0593559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  69.66 
 
 
200 aa  259  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1669  hypothetical protein  65.03 
 
 
204 aa  255  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1210  metal-dependent phosphohydrolase  70.06 
 
 
195 aa  254  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  46.93 
 
 
221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  50.28 
 
 
192 aa  181  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  46.37 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 
196 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.970173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 
184 aa  151  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2660  metal-dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
188 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2676  metal-dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
188 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560092  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2631  metal-dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
188 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  38.96 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  36.47 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  31.73 
 
 
201 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0865  hypothetical protein  34.15 
 
 
273 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.90175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4267  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 
181 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>