19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1210 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1210  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
195 aa  407  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1488  hypothetical protein  69.89 
 
 
200 aa  280  9e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.395351  normal  0.0680353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1476  hypothetical protein  66.14 
 
 
196 aa  261  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.288269  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3407  metal dependent phosphohydrolase  66.31 
 
 
209 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2610  metal dependent phosphohydrolase  70.06 
 
 
190 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.0160149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3234  metal-dependent phosphohydrolase  68.11 
 
 
203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3061  HD phosphohydrolase  65.78 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3130  hypothetical protein  64.36 
 
 
196 aa  249  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0593559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1669  hypothetical protein  59.79 
 
 
204 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396  phosphohydrolase family protein  46.59 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.891206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0539  metal dependent phosphohydrolase  48.02 
 
 
192 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1458  hypothetical protein  46.02 
 
 
189 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.276771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1760  metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
184 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232262  normal  0.0230992 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3187  metal dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 
196 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.970173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2660  metal-dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2676  metal-dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560092  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2631  metal-dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  38.96 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  36.9 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>