272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2645 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  99.67 
 
 		 302 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 302 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  85.86 
 
 		 303 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  69.4 
 
 		 312 aa  363  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  66.88 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  60.77 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  60.65 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  60.78 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  60.13 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  61.41 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  61.24 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  61.24 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  61.24 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  61.24 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  61.24 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  61.24 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  60.46 
 
 		 297 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  60.46 
 
 		 297 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  58.26 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  59.68 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  60.32 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  59.68 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  60.61 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  58.47 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  49.15 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  49.17 
 
 		 275 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  49.37 
 
 		 282 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  42.18 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  47.97 
 
 		 279 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  42.92 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  45.75 
 
 		 274 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  42.08 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  43.66 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  43.66 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  47.64 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  43.4 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  41.18 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  44.34 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  39.83 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  35.41 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3380  cytochrome c assembly protein  41.63 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  37.66 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  44.59 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  41.67 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  37.61 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  39 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  41.45 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  42.39 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  43.5 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  41.46 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  40.86 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  46.27 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  40.82 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  32.76 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  37.37 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  37.37 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  40.54 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  35.5 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  43.54 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  40.12 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  40.12 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  40.14 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  31.67 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  33.91 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  31.93 
 
 		 268 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  31.54 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  35.04 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  36.24 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  41.25 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  40.49 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  40.76 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  34.97 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  35.91 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  28.99 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  32.1 
 
 		 265 aa  85.9  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  35.52 
 
 		 182 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  36.21 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  30.45 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  27.04 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  31.2 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  30.13 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  26.2 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  27.04 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.69 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  27.23 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  27.16 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  34.17 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  27.16 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  27.16 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  27.16 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  26.09 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.86 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.82 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  26.84 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  32.51 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3092  cytochrome c assembly protein  27.67 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000526591  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  25.97 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  26.41 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>