160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  100 
 
 
266 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  76.42 
 
 
270 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  76.05 
 
 
269 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  73 
 
 
283 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  73.38 
 
 
283 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  74.14 
 
 
269 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  75.56 
 
 
266 aa  343  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  74.3 
 
 
284 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  74.3 
 
 
270 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  75.19 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  73.68 
 
 
266 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  43.02 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  52.94 
 
 
280 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  40.94 
 
 
269 aa  188  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  47.23 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  44.71 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  44.92 
 
 
269 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  44.11 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  41.67 
 
 
266 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  41.28 
 
 
265 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  38.72 
 
 
255 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  42.79 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  37.85 
 
 
262 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  36.29 
 
 
263 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  39.82 
 
 
269 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  35.69 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  41.96 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  39 
 
 
268 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  43.8 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  35.68 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  38.02 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  34.58 
 
 
263 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  36.86 
 
 
282 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  34.46 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  39.81 
 
 
264 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 
262 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  36.32 
 
 
282 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  37.67 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  35.09 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  41.46 
 
 
263 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  34.98 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4075  cytochrome C assembly family protein  32.54 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186491  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  34.68 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  34.68 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02500  predicted inner membrane protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.048331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3000  putative cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000509297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3850  putative cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000010196  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02464  hypothetical protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0370315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1072  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  normal  0.0177644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2770  putative cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000534415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2895  putative cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  32.95 
 
 
262 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 
262 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  32.56 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  32.95 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  32.95 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  32.95 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  33.89 
 
 
312 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  31.71 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  36.29 
 
 
262 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 
309 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 
305 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  33.18 
 
 
280 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  37.95 
 
 
262 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  33.18 
 
 
263 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0647  inner membrane protein, putative cytochrome c assembly protein  34.58 
 
 
264 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  31.47 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  33.74 
 
 
264 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  34.5 
 
 
274 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3092  cytochrome c assembly protein  30.67 
 
 
288 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000526591  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  31.27 
 
 
262 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1428  permease  33.76 
 
 
265 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  35.43 
 
 
266 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  35.43 
 
 
266 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  30.17 
 
 
315 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  33.19 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  33.19 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
290 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  33.73 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  33.33 
 
 
299 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  33.19 
 
 
297 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  33.62 
 
 
298 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  34.48 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  34.02 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>