227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3380 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3380  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 266 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  81.58 
 
 		 266 aa  335  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  60.15 
 
 		 267 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  68.91 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  67.66 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  67.66 
 
 		 266 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  73.09 
 
 		 224 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  66.24 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  68.64 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  56.58 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  54.17 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  41.35 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  39.81 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  41.87 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  40.16 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  34.02 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  38.74 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  39.76 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  39.18 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  39.91 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  39.18 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  37.71 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  38.4 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  37.8 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  40.18 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  40.64 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  37.44 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  40.27 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  41.63 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  41.63 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  38.84 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  39.77 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  40.51 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  39.87 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  39.87 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  39.87 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  39.46 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  36.49 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  36.49 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  40.35 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  35.81 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  44 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  34 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  29.17 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  39.18 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  44.66 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  29.9 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  32.89 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  30.22 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  32.13 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  37.41 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  38.22 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  33.53 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  27.56 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  44.54 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  31.54 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  39.52 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  36.82 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  39.01 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  35.66 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  38.32 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  46.46 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  33.17 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  34.27 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  27 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  31.73 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  35.37 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  45.1 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  27.56 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  26.79 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  30.92 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  27.23 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  30.46 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  30.61 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.29 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.29 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  26.76 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  27.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  27.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  25 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  27.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  34.57 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  34.57 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  27.11 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  27.76 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  27.11 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>