285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3439 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  93.53 
 
 		 305 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  85.08 
 
 		 314 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  80.58 
 
 		 297 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  79.29 
 
 		 298 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  80.26 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  79.94 
 
 		 297 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  79.94 
 
 		 297 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  77.99 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  77.02 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  77.02 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  77.59 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  62.94 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  59.87 
 
 		 315 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  60.75 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  60.38 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  60.06 
 
 		 302 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  48.86 
 
 		 276 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  49.03 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  47.79 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  41.94 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  51.67 
 
 		 275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  43.85 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  45.83 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  44.35 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  42.97 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  45.95 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  45.95 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  40.74 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  41.13 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  41.63 
 
 		 224 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  39.34 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  43.55 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  43.5 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  39.92 
 
 		 269 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 		 269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  38.97 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  41.85 
 
 		 266 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3380  cytochrome c assembly protein  38.19 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  39.8 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  33.07 
 
 		 268 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  39.29 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  40.65 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  38.42 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  40.31 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  38.27 
 
 		 269 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  29.39 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  33.75 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  38.85 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  38.85 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  38.85 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  38.85 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  40.51 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  31.98 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  35.9 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  31.78 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  39.16 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  32.03 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  44.59 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  33.97 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  36.84 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 		 255 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  29.07 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  32.5 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  28.04 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 		 262 aa  85.9  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  40.48 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  40.48 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.18 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  36.42 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.86 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  40.76 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  31.06 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  27.14 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  27.36 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.81 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.56 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  32.57 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  32.57 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  26.72 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  30.51 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  25.52 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  26.14 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  32.02 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  29.49 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  28.14 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  29.38 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  29.41 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  37.89 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>