249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0961 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 270 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  74.45 
 
 		 266 aa  316  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  74.45 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  63.67 
 
 		 267 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  72.69 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  68.49 
 
 		 271 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  70.04 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3380  cytochrome c assembly protein  68.31 
 
 		 266 aa  275  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  68.87 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  62.23 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  57.74 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  42.74 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  45.62 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  40.55 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  38.8 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  36.69 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  40.77 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  40.74 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  41.53 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  40.73 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  37.96 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  41.95 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  42.47 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  42.47 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  42.47 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  41.53 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  39.02 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  39.48 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  38.5 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  42.08 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  42.08 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  36.4 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  36.4 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  36.71 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  37.8 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  28.63 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  33.04 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  35.59 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  28.98 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  31.55 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  33.97 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  36.67 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  38.12 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  33.73 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  35.43 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  31.03 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  36.54 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  40.72 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  32.87 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  48.51 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  40.12 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  31.84 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  32.08 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  40.69 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  39.29 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  26.97 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  35 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  35 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  29.78 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  34.01 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  34.01 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  31.5 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  36.62 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  33.96 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  28.16 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  27.39 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  27.39 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  27.39 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  25.71 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  28.14 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  30.4 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  32.7 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  42.72 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  30.73 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  27.75 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  27.83 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  26.92 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  27.43 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  27.43 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  27.43 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  27.43 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  31.25 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>