129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1157 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  92.72 
 
 		 262 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  84.73 
 
 		 262 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  82.06 
 
 		 262 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  84.35 
 
 		 262 aa  427  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  83.97 
 
 		 262 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  83.97 
 
 		 262 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  83.97 
 
 		 262 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  87.74 
 
 		 262 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  83.21 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  83.59 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  83.21 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  83.21 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  83.21 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  76.72 
 
 		 262 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  77.39 
 
 		 262 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  40.86 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  43.08 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02500  predicted inner membrane protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.048331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3000  putative cytochrome C assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000509297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3850  putative cytochrome C assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000010196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2770  putative cytochrome C assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000534415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2895  putative cytochrome C assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1072  cytochrome c assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  normal  0.0177644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02464  hypothetical protein  43.89 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0370315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  40.86 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  40.46 
 
 		 284 aa  194  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  41.63 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0647  inner membrane protein, putative cytochrome c assembly protein  42.37 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3092  cytochrome c assembly protein  40.08 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000526591  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  41.22 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  41.22 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  41.22 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  40.48 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1122  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0765442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3205  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00378275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  37.3 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  38.17 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0989  cytochrome c assembly protein  40.46 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00443363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4075  cytochrome C assembly family protein  38.55 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1428  permease  39.55 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  38.75 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  32.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  34.06 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  33.59 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  30.92 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  30.08 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  31.42 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  30.2 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  30.45 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  29.33 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  29.79 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  32.21 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  27.23 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  30.13 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  29.91 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  28.86 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  35.95 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  29.72 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  30.25 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  29.53 
 
 		 268 aa  88.6  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  30.62 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  29.34 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  32.79 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  31.09 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  28.7 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  33.56 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  33.56 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  32.39 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  27.19 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  27.19 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  36.43 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  28.07 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  28.02 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  31.43 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  36.96 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  27.59 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  24.18 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  24.7 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  38.78 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  25.88 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  23.72 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  30.99 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  30.99 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  24.17 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  24.12 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  26.59 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  26.59 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  26.59 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  26.59 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  26.59 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>