209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1361 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1297  hypothetical protein  97.88 
 
 		 283 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0133713  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  89.75 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  85.02 
 
 		 301 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  87.78 
 
 		 270 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1322  hypothetical protein  79.85 
 
 		 277 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  80.22 
 
 		 271 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2023  hypothetical protein  80.22 
 
 		 271 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0775457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6074  hypothetical protein  80.22 
 
 		 271 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2003  hypothetical protein  80.22 
 
 		 271 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  79.48 
 
 		 271 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  79.48 
 
 		 271 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  79.1 
 
 		 287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1539  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000339618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2566  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  79.1 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2043  hypothetical protein  77.99 
 
 		 271 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000286207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  79.1 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2039  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3272  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2420  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2476  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00018837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1311  hypothetical protein  78.36 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000394602  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  72.01 
 
 		 275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  69.49 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  67.8 
 
 		 273 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  66.79 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1815  hypothetical protein  65.93 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  65.19 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  64.44 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  65.19 
 
 		 273 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  64.44 
 
 		 276 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  64.44 
 
 		 276 aa  363  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  66.29 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  63.53 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2656  hypothetical protein  66.42 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000624696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  60.38 
 
 		 272 aa  349  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  51.48 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1498  hypothetical protein  50.77 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1485  hypothetical protein  50.77 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2204  hypothetical protein  52.04 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1889  hypothetical protein  50.56 
 
 		 274 aa  285  9e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.213154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41680  hypothetical protein  48.85 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0999  protein of unknown function DUF299  51.31 
 
 		 273 aa  278  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3538  hypothetical protein  48.85 
 
 		 272 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2084  hypothetical protein  49.23 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00711246  normal  0.0225535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2081  hypothetical protein  49.62 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1884  hypothetical protein  48.85 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1592  hypothetical protein  48.85 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1599  hypothetical protein  48.85 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.852515  hitchhiker  0.0000000322533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3659  hypothetical protein  49.23 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717061  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23260  hypothetical protein  48.85 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0219  hypothetical protein  52.27 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1769  hypothetical protein  48.08 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2089  hypothetical protein  47.31 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1870  hypothetical protein  48.46 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142601  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2291  hypothetical protein  47.31 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2716  hypothetical protein  48.08 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00410652  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2550  hypothetical protein  47.33 
 
 		 270 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1548  hypothetical protein  48.26 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000386745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1842  hypothetical protein  44.65 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1736  hypothetical protein  44.65 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2578  hypothetical protein  49.43 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.3778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2244  hypothetical protein  47.47 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.277216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2073  hypothetical protein  45.35 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2645  hypothetical protein  47.08 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2421  hypothetical protein  48.71 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2482  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1862  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0232488  hitchhiker  0.0000000237766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2489  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.230997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2602  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00819794  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1591  hypothetical protein  47.08 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00125366  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1666  hypothetical protein  47.08 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00389139  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1735  hypothetical protein  47.08 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0066836  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2010  hypothetical protein  46.3 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00923  hypothetical protein  48.13 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2298  hypothetical protein  45.14 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2063  hypothetical protein  46.27 
 
 		 277 aa  251  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.557113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2173  hypothetical protein  43.54 
 
 		 292 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0501659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1907  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01672  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1939  protein of unknown function DUF299  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01661  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1783  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1928  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.868856  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1921  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2421  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1487  hypothetical protein  44.65 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.88593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1744  hypothetical protein  44.28 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59069  normal  0.0126649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2759  hypothetical protein  44.28 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2457  hypothetical protein  44.28 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1688  hypothetical protein  43.54 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1743  hypothetical protein  45.39 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  46.49 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1477  hypothetical protein  44.28 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1443  hypothetical protein  44.28 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.222292  normal  0.0952573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1459  hypothetical protein  44.28 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1997  hypothetical protein  44.28 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.140597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1825  hypothetical protein  44.28 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0950  hypothetical protein  46.56 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034537  hitchhiker  0.00814679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>