209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1870 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1870  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142601  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2716  hypothetical protein  92.59 
 
 
270 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00410652  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1548  hypothetical protein  90.37 
 
 
270 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000386745  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2550  hypothetical protein  87.78 
 
 
270 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2244  hypothetical protein  87.41 
 
 
270 aa  500  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.277216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1862  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0232488  hitchhiker  0.0000000237766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2645  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2602  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00819794  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1591  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00125366  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1666  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00389139  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1735  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0066836  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2489  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.230997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2482  hypothetical protein  87.04 
 
 
270 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2073  hypothetical protein  84.81 
 
 
270 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2010  hypothetical protein  84.44 
 
 
270 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2298  hypothetical protein  83.7 
 
 
270 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1744  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  354  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59069  normal  0.0126649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1825  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1477  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1459  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1443  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.222292  normal  0.0952573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1997  hypothetical protein  61.76 
 
 
277 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.140597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01672  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1939  protein of unknown function DUF299  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1928  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.868856  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2421  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1783  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01661  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1921  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1487  hypothetical protein  60.89 
 
 
277 aa  350  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.88593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1907  hypothetical protein  60.52 
 
 
277 aa  348  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2173  hypothetical protein  60.89 
 
 
292 aa  345  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0501659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1736  hypothetical protein  59.71 
 
 
273 aa  344  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1842  hypothetical protein  59.71 
 
 
273 aa  344  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1656  hypothetical protein  60.44 
 
 
273 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2457  hypothetical protein  59.78 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2759  hypothetical protein  59.34 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  58.89 
 
 
270 aa  335  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1743  hypothetical protein  56.67 
 
 
270 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1688  hypothetical protein  58.24 
 
 
273 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3013  hypothetical protein  57.62 
 
 
269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.369188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1884  hypothetical protein  53.33 
 
 
271 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1498  hypothetical protein  49.45 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1485  hypothetical protein  49.45 
 
 
271 aa  288  6e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1406  hypothetical protein  53.21 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.968755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1769  hypothetical protein  51.3 
 
 
272 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128839  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3538  hypothetical protein  50.19 
 
 
272 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1599  hypothetical protein  50.93 
 
 
272 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.852515  hitchhiker  0.0000000322533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  48.89 
 
 
279 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23260  hypothetical protein  50.92 
 
 
272 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1889  hypothetical protein  48.7 
 
 
274 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.213154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41680  hypothetical protein  49.82 
 
 
274 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2291  hypothetical protein  50.19 
 
 
272 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3659  hypothetical protein  50.56 
 
 
272 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717061  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1592  hypothetical protein  50.19 
 
 
272 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2081  hypothetical protein  50.56 
 
 
272 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2089  hypothetical protein  49.81 
 
 
272 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1297  hypothetical protein  48.85 
 
 
283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0133713  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2084  hypothetical protein  48.71 
 
 
272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00711246  normal  0.0225535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1361  hypothetical protein  48.46 
 
 
283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1539  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000339618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2566  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  47.19 
 
 
270 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2039  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3272  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2420  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2476  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00018837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1311  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000394602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  47.37 
 
 
301 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  46.86 
 
 
271 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  46.49 
 
 
271 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2043  hypothetical protein  46.13 
 
 
271 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000286207  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000647  hypothetical protein  45.93 
 
 
278 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  46.44 
 
 
287 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  45.38 
 
 
272 aa  258  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  46.49 
 
 
271 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1322  hypothetical protein  46.13 
 
 
277 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2023  hypothetical protein  46.49 
 
 
271 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0775457  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6074  hypothetical protein  46.49 
 
 
271 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2003  hypothetical protein  46.49 
 
 
271 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  47.19 
 
 
273 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  45.76 
 
 
271 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2063  hypothetical protein  47.06 
 
 
277 aa  255  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.557113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  50.38 
 
 
272 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06516  hypothetical protein  45.93 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1434  hypothetical protein  45.72 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.855311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0252  hypothetical protein  45.93 
 
 
277 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0997  hypothetical protein  44.44 
 
 
282 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.292387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0219  hypothetical protein  45.15 
 
 
273 aa  248  7e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  47.19 
 
 
276 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  47.19 
 
 
276 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0950  hypothetical protein  44.69 
 
 
299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034537  hitchhiker  0.00814679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1334  hypothetical protein  45.59 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0121091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1035  hypothetical protein  45.59 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0046897  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  47.89 
 
 
273 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2400  hypothetical protein  45.32 
 
 
273 aa  241  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238521  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1815  hypothetical protein  45.56 
 
 
273 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  45.69 
 
 
273 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  45.19 
 
 
273 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>