More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2685 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2685  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3494  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.95 
 
 
245 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1895  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.83 
 
 
247 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1902  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
249 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199647  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
252 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
255 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5251  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
220 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
257 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
265 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
257 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
257 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
257 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
265 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
265 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
259 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  42.03 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
266 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
259 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
261 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
260 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
263 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
258 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
268 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
254 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
267 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
265 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
259 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
259 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.4 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1831  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
365 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
273 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
256 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
256 aa  118  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.23 
 
 
261 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
257 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0110  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
797 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
259 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.85 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
256 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
265 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  35.85 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
260 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
254 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.85 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  35.85 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  36.98 
 
 
261 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
271 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  34.88 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  34.5 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.37 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  35.47 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.4 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3963  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  34.5 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  34.5 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  34.5 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>