58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5575 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  73.67 
 
 		 339 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  71.62 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  65.49 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  65.49 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  65.19 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  70.96 
 
 		 315 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  70.96 
 
 		 315 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  70.96 
 
 		 315 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  64.9 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5159  hypothetical protein  62.91 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  62.09 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  61.42 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  61.72 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  61.72 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  61.13 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  61.79 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  61.13 
 
 		 356 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  56.69 
 
 		 343 aa  362  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  51.48 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  54.43 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  27.12 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  25.51 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  22.58 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  28.93 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  25.33 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  23.51 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  25.24 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  23.18 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  25.17 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  22.85 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  25.61 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  24.48 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  26.22 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  23.71 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  23.18 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  24.67 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  27.31 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  23.47 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  25.74 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  23.84 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  27.68 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  29.96 
 
 		 463 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  27.44 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  24.14 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  24.41 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1889  hypothetical protein  29.02 
 
 		 461 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.048244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  28.51 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  24.34 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  25.42 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  26.75 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>