56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1956 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  57.48 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  57.77 
 
 		 339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  57.77 
 
 		 339 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  60.32 
 
 		 315 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  57.77 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  58.58 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  60.32 
 
 		 315 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  60.32 
 
 		 315 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  57.77 
 
 		 335 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  56.8 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  52.99 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  54.43 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  51.02 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  52.11 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  53.29 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  53.29 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  52.69 
 
 		 342 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5159  hypothetical protein  52.1 
 
 		 376 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  51.5 
 
 		 342 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  51.8 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  29.19 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  29.43 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  27.57 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  27.89 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  26.53 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  26.16 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  25.57 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  27.95 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  27.42 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  27.09 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  27.48 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  27.48 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  26.01 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  27.91 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  27.52 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  26.35 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  28.38 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  26.21 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  28.38 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  25.68 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  28.38 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  27.18 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  25.18 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  27.11 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  26.76 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  25.37 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  27.86 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  24.15 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  25.25 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  24.34 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4798  hypothetical protein  30.83 
 
 		 406 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0662939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  25.8 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  25.66 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  25.32 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>