48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5242 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  94.74 
 
 		 342 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  98.83 
 
 		 356 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  93.86 
 
 		 342 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  94.74 
 
 		 342 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5159  hypothetical protein  93.26 
 
 		 376 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  79.77 
 
 		 345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  78.89 
 
 		 345 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  63.61 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  63.61 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  63.91 
 
 		 397 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  63.61 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  63.61 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  65.71 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  65.71 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  61.61 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  65.71 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  61.13 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  55.88 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  51.5 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  47.63 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  25.45 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  23.79 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  26.34 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  28.27 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  25.46 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  24.92 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  25.32 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  23.68 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  24.07 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  27.85 
 
 		 267 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  22.56 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  24.51 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  24.6 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  24.24 
 
 		 301 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  23.51 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  24.09 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2687  hypothetical protein  76.67 
 
 		 126 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  24.23 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  25.09 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  23.33 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  23.33 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  22.59 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  24.18 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  22.96 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  22.93 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>