60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2082 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  98.23 
 
 
335 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  99.41 
 
 
339 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  96.46 
 
 
397 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  99.71 
 
 
339 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  99.37 
 
 
315 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  99.37 
 
 
315 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5159  hypothetical protein  65.09 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  65.09 
 
 
342 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  65.09 
 
 
342 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  65.98 
 
 
339 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  65.49 
 
 
339 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  64.2 
 
 
342 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  63.61 
 
 
342 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  63.91 
 
 
356 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  63.39 
 
 
345 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  63.1 
 
 
345 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  64.33 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  57.77 
 
 
340 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  51.79 
 
 
339 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  27.51 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  24.76 
 
 
301 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  27.12 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  26 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  27.45 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  27.96 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  27.12 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  27.45 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  25.5 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  26.8 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  25.99 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  27.85 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  25.42 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  25.41 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  25.66 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  25.66 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  25.91 
 
 
265 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  26.76 
 
 
266 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  25.66 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  25.66 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  30.91 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  24.41 
 
 
263 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  28.83 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  30.55 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  26.67 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  26.09 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  24.07 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  26.07 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  27.98 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  25.6 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  26.62 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  24.01 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  25.85 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  28.52 
 
 
463 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  32.53 
 
 
464 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  22.46 
 
 
309 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  31.33 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5170  hypothetical protein  31.33 
 
 
464 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5260  hypothetical protein  31.5 
 
 
464 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>