50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3682 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  72.11 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  70.65 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  67.24 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  67.58 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  60.28 
 
 		 301 aa  358  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  38.6 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  37.54 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  37.76 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  40.77 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  40.23 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  35.66 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  35.29 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  37.98 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  35.69 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  35.66 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  38.8 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  35.89 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  37.05 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  35.31 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  35.07 
 
 		 267 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  35.31 
 
 		 267 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  36.11 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  36.01 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  35.31 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  35.31 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  34.27 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  34.27 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  36.19 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  35.32 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5707  predicted protein  31.95 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135503  hitchhiker  0.00193924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  28.34 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  28.53 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  27.7 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  26.23 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  26.62 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  26.23 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  24.14 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  26.62 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  25.63 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  24.57 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  23.87 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  23.87 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  24.65 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  23.96 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>