50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2736 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  68.99 
 
 
263 aa  361  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  67.44 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  68.34 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  60.08 
 
 
266 aa  322  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  60.84 
 
 
265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  59.54 
 
 
266 aa  319  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  60.31 
 
 
266 aa  318  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  59.77 
 
 
267 aa  317  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  58.56 
 
 
267 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  58.56 
 
 
267 aa  315  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  58.56 
 
 
267 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  58.17 
 
 
267 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  58.78 
 
 
267 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  58.94 
 
 
265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  58.4 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  58.4 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  58.02 
 
 
267 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  59.16 
 
 
265 aa  311  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  57.79 
 
 
266 aa  301  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  56.65 
 
 
267 aa  298  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  55.89 
 
 
267 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  56.81 
 
 
257 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  53.64 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  55.85 
 
 
268 aa  288  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  46.18 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  37.76 
 
 
294 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  39.45 
 
 
309 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  37.59 
 
 
305 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  35.99 
 
 
302 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  36.96 
 
 
301 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  36.9 
 
 
303 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  32.89 
 
 
313 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  30.07 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5707  predicted protein  27.52 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135503  hitchhiker  0.00193924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  26.09 
 
 
340 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  25.27 
 
 
339 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  24.92 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  23.64 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  23.64 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  23.64 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  24.01 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  24.01 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  24.37 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  23.27 
 
 
345 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  32.84 
 
 
339 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  24.36 
 
 
345 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  24.01 
 
 
335 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  24 
 
 
342 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  24 
 
 
342 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>