56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0165 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  64.93 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  64.81 
 
 		 267 aa  363  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  63.53 
 
 		 266 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  63.7 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  63.33 
 
 		 267 aa  352  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  63.57 
 
 		 265 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  62.96 
 
 		 267 aa  349  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  62.55 
 
 		 266 aa  349  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  60.67 
 
 		 266 aa  349  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  62.96 
 
 		 267 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  62.55 
 
 		 265 aa  348  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  62.78 
 
 		 267 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  62.78 
 
 		 267 aa  348  7e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  62.78 
 
 		 267 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  62.78 
 
 		 267 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  62.78 
 
 		 267 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  62.41 
 
 		 266 aa  346  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  60.53 
 
 		 265 aa  335  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  57.84 
 
 		 265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  57.36 
 
 		 257 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  54.37 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  53.23 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  55.85 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  54.79 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  46.42 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  35.69 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  34.35 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  35.32 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  35.46 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  36.29 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  36.25 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  31.88 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5707  predicted protein  27.41 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135503  hitchhiker  0.00193924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  27.96 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  27.96 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  27.96 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  27.96 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  27.96 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  26.09 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  26.06 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  28.93 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  26.64 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1822  hypothetical protein  26.16 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0061049  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  26.32 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  26.34 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  26.34 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  25.93 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  25.93 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  25.93 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  23.67 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>