55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3514 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  68.77 
 
 
302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  69.02 
 
 
305 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  68.23 
 
 
309 aa  434  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  67.24 
 
 
294 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  61.86 
 
 
301 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  35.86 
 
 
263 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  37.75 
 
 
257 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  34.38 
 
 
263 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  36.9 
 
 
264 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  36.25 
 
 
267 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  36.29 
 
 
267 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  36.25 
 
 
267 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  34.62 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  34.04 
 
 
266 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  33.8 
 
 
266 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  33.92 
 
 
265 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  36.14 
 
 
266 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  34.62 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  33.57 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  33.92 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  33.92 
 
 
267 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  33.92 
 
 
267 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  36.14 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  36.29 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  35.34 
 
 
267 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  33.22 
 
 
267 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  35.34 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  33.22 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  34.54 
 
 
267 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  33.22 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5707  predicted protein  32.72 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135503  hitchhiker  0.00193924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  27.12 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  28.15 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  26.07 
 
 
339 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  26.07 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  26.07 
 
 
339 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  26.07 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  26.07 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  26.45 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  26.07 
 
 
339 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  26.62 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  26.22 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  27.44 
 
 
339 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  25.5 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  28.93 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  24.92 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  25.5 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  25.72 
 
 
345 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  25.26 
 
 
345 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  25.25 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  26 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  26.79 
 
 
340 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5159  hypothetical protein  25.45 
 
 
376 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>