57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0812 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  546  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  88.3 
 
 		 265 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  84.41 
 
 		 266 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  77.74 
 
 		 265 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  78.41 
 
 		 267 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  78.41 
 
 		 267 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  78.49 
 
 		 266 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  78.03 
 
 		 267 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  77.27 
 
 		 267 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  75.85 
 
 		 267 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  74.72 
 
 		 267 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  74.72 
 
 		 267 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  74.72 
 
 		 267 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  74.72 
 
 		 267 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  73.86 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  66.92 
 
 		 267 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  65.79 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  63.57 
 
 		 268 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  61.28 
 
 		 266 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0428  hypothetical protein  62.12 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00495  hypothetical protein  64.06 
 
 		 257 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  59.25 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2736  hypothetical protein  60.84 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  60 
 
 		 263 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  60.7 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  48.67 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3682  Os10g0463800; hypothetical protein  35.29 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2916  hypothetical protein  37.37 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000607971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1567  hypothetical protein  36.49 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2419  hypothetical protein  36.2 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.458509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3514  hypothetical protein  34.62 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.959488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6352  hypothetical protein  35.31 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0216  hypothetical protein  31.65 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0666857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4453  hypothetical protein  30.41 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5707  predicted protein  27.41 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135503  hitchhiker  0.00193924 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0498  hypothetical protein  25.5 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0895  hypothetical protein  25.83 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.650866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1985  hypothetical protein  25.5 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0777  hypothetical protein  26.16 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2082  hypothetical protein  25.5 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0680  hypothetical protein  26.16 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0568  hypothetical protein  26.16 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.236138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1956  hypothetical protein  26.53 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1633  hypothetical protein  25.91 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.752873  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5534  hypothetical protein  25.71 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4329  hypothetical protein  27.52 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  25 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3467  hypothetical protein  23.81 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6756  hypothetical protein  23.84 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4054  hypothetical protein  23.81 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5159  hypothetical protein  24.42 
 
 		 376 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2771  hypothetical protein  23.08 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5242  hypothetical protein  23.79 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2689  hypothetical protein  23.39 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3410  hypothetical protein  23.79 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.954571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  23.26 
 
 		 343 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1822  hypothetical protein  25.81 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0061049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>