24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1822 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1822  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0061049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1625  hypothetical protein  23.65 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.542043  normal  0.294024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00076  hypothetical protein  23.87 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0620  hypothetical protein  26.35 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0165  hypothetical protein  26.16 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0614  hypothetical protein  25.63 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3416  hypothetical protein  25.63 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.203924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0648  hypothetical protein  26.62 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00468726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0613  hypothetical protein  25.63 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3877  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002278  hypothetical protein  23.87 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3694  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0574  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.437013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3751  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3296  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0989323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2192  hypothetical protein  24.58 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3513  hypothetical protein  25.29 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.571436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2891  hypothetical protein  23.33 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3008  hypothetical protein  25.32 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0581  hypothetical protein  24.27 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175225  normal  0.68343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0812  hypothetical protein  25.81 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186886  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0718  hypothetical protein  23.38 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1057  hypothetical protein  20.33 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0658  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000929387  hitchhiker  0.0000323838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>