47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1889 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  69.48 
 
 		 464 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  69.48 
 
 		 464 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2046  hypothetical protein  71.46 
 
 		 458 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  941    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.048244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  90.85 
 
 		 463 aa  861    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5170  hypothetical protein  68.61 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5260  hypothetical protein  68.61 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3165  hypothetical protein  64.55 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1714  hypothetical protein  65.73 
 
 		 468 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1961  hypothetical protein  61.78 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.588491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2663  hypothetical protein  62.37 
 
 		 469 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.744438  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2575  hypothetical protein  60.97 
 
 		 478 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3786  protein of unknown function DUF1338  61.05 
 
 		 470 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4115  protein of unknown function DUF1338  61.49 
 
 		 470 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0907  hypothetical protein  59.16 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.327128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1460  hypothetical protein  58.28 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1250  hypothetical protein  60.85 
 
 		 487 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0850  hypothetical protein  58.94 
 
 		 488 aa  531  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.623293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3157  hypothetical protein  56.99 
 
 		 472 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0349  protein of unknown function DUF1338  60.44 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0894  hypothetical protein  58.15 
 
 		 465 aa  521  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3628  hypothetical protein  57.89 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8485  protein of unknown function DUF1338  60.05 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0664  hypothetical protein  59.6 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03979  hypothetical protein  59.91 
 
 		 455 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.616638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2223  protein of unknown function DUF1338  57.05 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2028  hypothetical protein  57.05 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  hitchhiker  0.0000000000691698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1648  hypothetical protein  57.27 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2236  hypothetical protein  57.27 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01392  hypothetical protein  57.05 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1602  hypothetical protein  57.27 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1505  hypothetical protein  57.27 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01380  hypothetical protein  57.05 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1751  hypothetical protein  57.05 
 
 		 447 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.98401e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1965  hypothetical protein  57.27 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1742  putative cytoplasmic protein  55.03 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1533  putative cytoplasmic protein  55.03 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1802  hypothetical protein  55.03 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.903691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1738  putative cytoplasmic protein  55.03 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1718  hypothetical protein  54.81 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5663  hypothetical protein  55.68 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.458256  normal  0.0265006 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00300  conserved hypothetical protein  48.79 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04380  hypothetical protein  39.35 
 
 		 459 aa  262  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.149311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4798  hypothetical protein  41.15 
 
 		 406 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0662939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13321  hypothetical protein  39.69 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1644  hypothetical protein  39.49 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.589728  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5575  hypothetical protein  29.02 
 
 		 339 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>