46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04380  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  915    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.149311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4798  hypothetical protein  54.36 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0662939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13321  hypothetical protein  55.02 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1644  hypothetical protein  55.02 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.589728  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1250  hypothetical protein  44.05 
 
 		 487 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4115  protein of unknown function DUF1338  43.11 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3157  hypothetical protein  41.31 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3786  protein of unknown function DUF1338  41.6 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3165  hypothetical protein  37.93 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  40.76 
 
 		 464 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  41.86 
 
 		 464 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0349  protein of unknown function DUF1338  43.57 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1460  hypothetical protein  40.65 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5170  hypothetical protein  41.86 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1714  hypothetical protein  41.28 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5260  hypothetical protein  41.86 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0664  hypothetical protein  43.23 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8485  protein of unknown function DUF1338  44.84 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1965  hypothetical protein  42.29 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5663  hypothetical protein  41.33 
 
 		 471 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.458256  normal  0.0265006 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0850  hypothetical protein  39.22 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.623293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3628  hypothetical protein  40.61 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0894  hypothetical protein  39.01 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1718  hypothetical protein  40.71 
 
 		 447 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1738  putative cytoplasmic protein  40.71 
 
 		 447 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0907  hypothetical protein  39 
 
 		 466 aa  275  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.327128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1742  putative cytoplasmic protein  40.71 
 
 		 447 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1533  putative cytoplasmic protein  40.71 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03979  hypothetical protein  40.87 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.616638  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1802  hypothetical protein  40.49 
 
 		 447 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.903691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2046  hypothetical protein  42.11 
 
 		 458 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00300  conserved hypothetical protein  39.31 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2223  protein of unknown function DUF1338  39.69 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01392  hypothetical protein  39.69 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1648  hypothetical protein  39.69 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01380  hypothetical protein  39.69 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1602  hypothetical protein  39.47 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2028  hypothetical protein  39.69 
 
 		 447 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  hitchhiker  0.0000000000691698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1751  hypothetical protein  39.69 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.98401e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2236  hypothetical protein  39.47 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1505  hypothetical protein  39.47 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  39.35 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1889  hypothetical protein  39.35 
 
 		 461 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.048244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2663  hypothetical protein  37.34 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.744438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1961  hypothetical protein  36.5 
 
 		 475 aa  253  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.588491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2575  hypothetical protein  36.27 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>