47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1644 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4798  hypothetical protein  83.99 
 
 
406 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0662939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1644  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  818    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.589728  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13321  hypothetical protein  72.41 
 
 
415 aa  531  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04380  hypothetical protein  55.02 
 
 
459 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.149311  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0664  hypothetical protein  40.95 
 
 
455 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00300  conserved hypothetical protein  40.13 
 
 
456 aa  263  6e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03979  hypothetical protein  39.95 
 
 
455 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.616638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3628  hypothetical protein  41.36 
 
 
482 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8485  protein of unknown function DUF1338  44.42 
 
 
464 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1965  hypothetical protein  39.04 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0894  hypothetical protein  35.63 
 
 
465 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1533  putative cytoplasmic protein  37.81 
 
 
447 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1718  hypothetical protein  37.81 
 
 
447 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2223  protein of unknown function DUF1338  37.61 
 
 
447 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1742  putative cytoplasmic protein  37.81 
 
 
447 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1802  hypothetical protein  37.81 
 
 
447 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.903691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1738  putative cytoplasmic protein  37.81 
 
 
447 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2028  hypothetical protein  37.84 
 
 
447 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  hitchhiker  0.0000000000691698 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01392  hypothetical protein  37.61 
 
 
447 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1602  hypothetical protein  37.84 
 
 
447 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01380  hypothetical protein  37.61 
 
 
447 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1648  hypothetical protein  37.61 
 
 
447 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2236  hypothetical protein  37.84 
 
 
447 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1505  hypothetical protein  37.84 
 
 
447 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5663  hypothetical protein  38.85 
 
 
471 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.458256  normal  0.0265006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3786  protein of unknown function DUF1338  39.12 
 
 
470 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4115  protein of unknown function DUF1338  38.96 
 
 
470 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1250  hypothetical protein  37.78 
 
 
487 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1460  hypothetical protein  41.32 
 
 
488 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1751  hypothetical protein  37.61 
 
 
447 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98401e-17 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0907  hypothetical protein  40.1 
 
 
466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.327128  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0850  hypothetical protein  40.1 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.623293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5260  hypothetical protein  38.83 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132132  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1889  hypothetical protein  39.49 
 
 
461 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.048244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5170  hypothetical protein  39.41 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  38.86 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3157  hypothetical protein  40.1 
 
 
472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0349  protein of unknown function DUF1338  38.15 
 
 
454 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2046  hypothetical protein  38.97 
 
 
458 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  39.41 
 
 
464 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  39.19 
 
 
464 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3165  hypothetical protein  36.09 
 
 
468 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1714  hypothetical protein  39.23 
 
 
468 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2663  hypothetical protein  36.61 
 
 
469 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.744438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1961  hypothetical protein  35.68 
 
 
475 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.588491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2575  hypothetical protein  35.67 
 
 
478 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3950  hypothetical protein  27.64 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0504277  normal  0.814713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>